Q13263

PTMD Annotation Information


※ Protein Information

Tag Content
UniProt Accession TIF1B_HUMAN; Q13263;
Entrez ID 10155
GenBank Protein ID
GenBank Nucleotide ID
Protein Name Transcription intermediary factor 1-beta (TIF1-beta) (E3 SUMO-protein ligase TRIM28) (EC 2.3.2.27) (KRAB-associated protein 1) (KAP-1) (KRAB-interacting protein 1) (KRIP-1) (Nuclear corepressor KAP-1) (RING finger protein 96) (RING-type E3 ubiquitin trans
Gene Name TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B
Organism Homo sapiens
NCBI Taxa ID 9606
Functional DescriptionNuclear corepressor for KRAB domain-containing zinc finger proteins (KRAB-ZFPs). Mediates gene silencing by recruiting CHD3, a subunit of the nucleosome remodeling and deacetylation (NuRD) complex, and SETDB1 (which specifically methylates histone H3 at 'Lys-9' (H3K9me)) to the promoter regions of KRAB target genes. Enhances transcriptional repression by coordinating the increase in H3K9me, the decrease in histone H3 'Lys-9 and 'Lys-14' acetylation (H3K9ac and H3K14ac, respectively) and the disposition of HP1 proteins to silence gene expression(view all)
Sequence
(Fasta)
MAASAAAASA AAASAASGSP GPGEGSAGGE KRSTAPSAAA SASASAAASS PAGGGAEALE 60
LLEHCGVCRE RLRPEREPRL LPCLHSACSA CLGPAAPAAA NSSGDGGAAG DGTVVDCPVC 120
KQQCFSKDIV ENYFMRDSGS KAATDAQDAN QCCTSCEDNA PATSYCVECS EPLCETCVEA 180
HQRVKYTKDH TVRSTGPAKS RDGERTVYCN VHKHEPLVLF CESCDTLTCR DCQLNAHKDH 240
QYQFLEDAVR NQRKLLASLV KRLGDKHATL QKSTKEVRSS IRQVSDVQKR VQVDVKMAIL 300
QIMKELNKRG RVLVNDAQKV TEGQQERLER QHWTMTKIQK HQEHILRFAS WALESDNNTA 360
LLLSKKLIYF QLHRALKMIV DPVEPHGEMK FQWDLNAWTK SAEAFGKIVA ERPGTNSTGP 420
APMAPPRAPG PLSKQGSGSS QPMEVQEGYG FGSGDDPYSS AEPHVSGVKR SRSGEGEVSG 480
LMRKVPRVSL ERLDLDLTAD SQPPVFKVFP GSTTEDYNLI VIERGAAAAA TGQPGTAPAG 540
TPGAPPLAGM AIVKEEETEA AIGAPPTATE GPETKPVLMA LAEGPGAEGP RLASPSGSTS 600
SGLEVVAPEG TSAPGGGPGT LDDSATICRV CQKPGDLVMC NQCEFCFHLD CHLPALQDVP 660
GEEWSCSLCH VLPDLKEEDG SLSLDGADST GVVAKLSPAN QRKCERVLLA LFCHEPCRPL 720
HQLATDSTFS LDQPGGTLDL TLIRARLQEK LSPPYSSPQE FAQDVGRMFK QFNKLTEDKA 780
DVQSIIGLQR FFETRMNEAF GDTKFSAVLV EPPPMSLPGA GLSSQELSGG PGDGP 836

※ PTM-Disease Association

NumPTMDiseaseCell TypeTypePTM SitePMID
1Serine PhosphorylationMelanomaA375 cell linePS82423096706
[Reference]: MAGE-C2 promotes growth and tumorigenicity of melanoma cells, phosphorylation of KAP1, and DNA damage repair


※ PTM Sites

PTM Modification Sites
Phosphorylation
(count: 71)
(view all)
102       AAPAAANSSGDGGAA     dbPAF
103       APAAANSSGDGGAAG     dbPAF
133       SKDIVENYFMRDSGS     dbPAF
138       ENYFMRDSGSKAATD     dbPAF
14        AASAAAASAASGSPG     dbPAF
140       YFMRDSGSKAATDAQ     dbPAF
Acetylation
(count: 24)
(view all)
121       VVDCPVCKQQCFSKD     PLMD
127       CKQQCFSKDIVENYF     PLMD
188       HQRVKYTKDHTVRST     PLMD
213       TVYCNVHKHEPLVLF     PLMD
238       DCQLNAHKDHQYQFL     PLMD
261       KLLASLVKRLGDKHA     PLMD
Ubiquitination
(count: 33)
(view all)
127       CKQQCFSKDIVENYF     PLMD
141       FMRDSGSKAATDAQD     PLMD
188       HQRVKYTKDHTVRST     PLMD
213       TVYCNVHKHEPLVLF     PLMD
238       DCQLNAHKDHQYQFL     PLMD
254       DAVRNQRKLLASLVK     PLMD
Sumoylation
(count: 25)
(view all)
127       CKQQCFSKDIVENYF     PLMD
185       VEAHQRVKYTKDHTV     PLMD
188       HQRVKYTKDHTVRST     PLMD
199       VRSTGPAKSRDGERT     PLMD
254       DAVRNQRKLLASLVK     PLMD
261       KLLASLVKRLGDKHA     PLMD
Malonylation
(count: 5)
254       DAVRNQRKLLASLVK     PLMD
261       KLLASLVKRLGDKHA     PLMD
319       VLVNDAQKVTEGQQE     PLMD
377       FQLHRALKMIVDPVE     PLMD
770       QDVGRMFKQFNKLTE     PLMD

※ Protein-Protein Interaction

NetworkInteraction
ABSource
A8MY82Q13263BioGRID
E9PG89Q13263HPRD
G3V1K3Q13263IntAct
H0Y2R1Q13263MINT
H0YBT0Q13263IntAct
O14709Q13263HPRD
O15164Q13263HPRD
O15479Q13263IntAct
O43464Q13263IntAct
O43918Q13263IntAct
O60765Q13263HPRD
O75376Q13263IntAct
O75815Q13263IntAct
O76071Q13263IntAct
O95229Q13263IntAct
P03372Q13263HPRD
P04150Q13263HPRD
P04637Q13263IntAct
P08670Q13263HPRD; IntAct; MINT
P17676Q13263HPRD
P19532Q13263IntAct
P21506Q13263HPRD; IntAct
P25054Q13263IntAct
P30480Q13263IntAct
P30504Q13263IntAct
P32121Q13263IntAct
P43356Q13263IntAct
P43357Q13263IntAct
P43360Q13263IntAct
P45973Q13263HPRD; IntAct; MINT
P60520Q13263IntAct
P62330Q13263IntAct
P63104Q13263MINT
P63165Q13263DIP
P78317Q13263MINT
P78396Q13263IntAct
P83916Q13263HPRD; IntAct
Q12873Q13263DIP; IntAct; MINT
Q13111Q13263HPRD
Q13177Q13263IntAct
Q13185Q13263HPRD; IntAct
Q13263Q13263HPRD
Q13263Q14140HPRD
Q13263Q14164IntAct
Q13263Q15047HPRD
Q13263Q16587HPRD
Q13263Q5VVX9IntAct
Q13263Q7Z3K3IntAct
Q13263Q8TAQ5IntAct
Q13263Q96CS4HPRD
Q13263Q96SR6HPRD
Q13263Q99608IntAct
Q13263Q9GZQ8IntAct
Q13263Q9H492IntAct
Q13263Q9HCI5IntAct
Q13263Q9P2S5IntAct
Q13263Q9UBF1IntAct
Q13263Q9UBN6IntAct
Q13263Q9UQ90HPRD; IntAct
Q13263Q9Y478IntAct
Q13263Q9Y4K3IntAct
Q13263Q9Y5V3IntAct
Q13263Q9Y6K9IntAct; MINT